代办工程报建手续费是工程项目在建设初期必须支付的一项费用，其计算涉及多个方面，体现了工程项目的复杂性和专业性。

首先，代办工程报建手续费主要包括报建费、审批费、办证费和咨询费等。报建费是向政府部门报批时所缴纳的费用，用于支持城市基础设施建设和发展，以及报建技术咨询服务的费用。审批费则包括环评审批费、消防审批费等，这些费用主要用于政府各部门对工程项目的审批流程，以确保项目的合规性和安全性。

办证费涉及工程在建设和运营过程中所需的各种证件办理费用，如施工许可证等，是项目合法运行的基础。咨询费则是聘请专业咨询机构进行项目咨询和策划的费用，有助于工程团队做出更加科学、合理的决策。在具体计算时，各项费用都有其特定的计算标准和依据。例如，报建费可能根据工程项目的规模和类型有所不同，审批费则与项目的环境影响和消防安全要求相关，办证费则取决于所需证件的种类和数量，咨询费则根据咨询服务的内容和质量而定。

此外，代办工程报建手续费还受到地区差异和行业差异的影响。不同地区和不同行业的工程项目，其报建手续费的计算标准和金额可能会有所不同。因此，在计算代办工程报建手续费时，需要充分考虑项目的具体情况和所在地的相关政策。

综上所述，代办工程报建手续费的计算是一个复杂而专业的过程，需要综合考虑多个方面和因素。