在租赁的5500平米的厂房中进行装修，需要进行以下报审：

1. 建筑工程施工许可证：根据相关法律法规的规定，在进行建筑工程的施工前，必须取得相应的建筑工程施工许可证。该证是证明施工单位具备相应资质和能力的证件之一。

2. 安全生产许可证：在装修过程中，涉及到一些危险作业或高危区域，如电焊、高空作业等，需要获得安全生产许可证才能开展。

3. 消防验收报告：在进行装修时，需要对建筑物内的消防设施进行检查和整改，确保符合国家规定的要求和安全标准后方可进行施工。因此，需要向当地消防部门提交相关的消防验收报告以获得许可。

4. 电工安装许可证：在装修中涉及电气设备安装和布线等环节，需要有电工安装许可证才能进行操作。

5. 水暖管道安装许可证：水暖管道的铺设和维修也需要有相应的许可证才能进行。

6. 防雷装置检测合格证：在建筑物内设置防雷装置是必要的，需要通过防雷装置检测合格证的审核。

7. 环保评估文件：在进行装修时，可能会产生一定的污染和噪音等问题，需要提交环保评估文件来证明其不会对周围环境造成不良影响。

8. 其他特殊要求的审批手续：如果租赁合同中有其他特殊的装修要求或限制条件，需要提交相应的申请和批准手续。例如，对于某些特定材料的使用或施工工艺的要求等。